MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidovorax sp. JS42 plasmid pAOVO02

Total Repeats: 242

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008766	CA	3	6	4766	4771	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008766	TCC	2	6	4780	4785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_008766	CCG	2	6	4794	4799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_008766	CGC	2	6	4808	4813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_008766	GGC	2	6	4826	4831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008766	T	8	8	4832	4839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008766	CGC	2	6	4850	4855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_008766	CGA	2	6	4859	4864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008766	CCA	2	6	4867	4872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_008766	GCA	2	6	4892	4897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008766	GGC	2	6	4915	4920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008766	GCC	2	6	5708	5713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_008766	T	6	6	6093	6098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008766	CCA	2	6	8181	8186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_008766	GCC	2	6	8192	8197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_008766	CTG	2	6	8202	8207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008766	GCC	2	6	8225	8230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_008766	GCC	2	6	8258	8263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_008766	TGG	2	6	8277	8282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008766	GCC	2	6	8291	8296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_008766	CTGGC	2	10	8312	8321	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_008766	CCG	2	6	8332	8337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_008766	GGC	2	6	8569	8574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008766	GCC	2	6	8581	8586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_008766	GCGG	2	8	8851	8858	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_008766	CGG	3	9	8856	8864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008766	GCCG	2	8	8889	8896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008766	GATCG	2	10	8931	8940	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_008766	GCG	2	6	9580	9585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008766	AAT	2	6	9594	9599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008766	CTT	2	6	10297	10302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008766	GCCG	2	8	10362	10369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008766	GAC	2	6	10386	10391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008766	GCT	2	6	10400	10405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008766	GCA	2	6	10416	10421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008766	CCCTC	2	10	12526	12535	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
37	NC_008766	CGG	2	6	24053	24058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008766	TGGC	2	8	24077	24084	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_008766	GCC	2	6	24104	24109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_008766	C	6	6	24108	24113	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41	NC_008766	TCA	2	6	24582	24587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008766	AGG	2	6	24978	24983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008766	CGC	2	6	26217	26222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_008766	GCC	2	6	26237	26242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_008766	GGC	2	6	26252	26257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008766	T	7	7	26258	26264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008766	A	6	6	26295	26300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008766	A	6	6	26386	26391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008766	CGC	2	6	26615	26620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_008766	GGT	2	6	26683	26688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008766	TGG	2	6	26741	26746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008766	CAG	2	6	29286	29291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008766	TG	3	6	29297	29302	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008766	TCG	2	6	29371	29376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008766	CCG	2	6	29383	29388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_008766	AG	3	6	29393	29398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008766	CCCA	2	8	29400	29407	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
58	NC_008766	GA	3	6	29443	29448	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008766	GCT	2	6	29454	29459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008766	CGC	2	6	29505	29510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_008766	GACT	2	8	29550	29557	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_008766	CGA	2	6	29656	29661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008766	TC	3	6	29672	29677	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008766	CGG	2	6	29750	29755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008766	ACA	2	6	29765	29770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008766	GCG	2	6	29816	29821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008766	GTC	2	6	29880	29885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008766	CGA	2	6	29990	29995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008766	C	6	6	30057	30062	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
70	NC_008766	AGT	2	6	30083	30088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008766	TCGCA	2	10	30095	30104	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_008766	CAA	2	6	30116	30121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008766	CGA	2	6	30208	30213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008766	GCA	2	6	30305	30310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008766	TCGC	2	8	30338	30345	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008766	TC	3	6	30351	30356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_008766	TCG	2	6	30380	30385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008766	CGT	2	6	30393	30398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008766	GCA	2	6	30407	30412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008766	AGC	2	6	30421	30426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008766	GCC	2	6	30427	30432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_008766	TCT	2	6	30448	30453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008766	GGGT	2	8	30473	30480	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008766	CCCAG	2	10	30886	30895	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
85	NC_008766	GCT	2	6	30907	30912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008766	CGGT	2	8	30920	30927	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_008766	CCG	2	6	31014	31019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_008766	GAC	2	6	31145	31150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008766	CGA	2	6	31159	31164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008766	CGG	3	9	31186	31194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008766	CT	3	6	31225	31230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008766	CAG	2	6	31259	31264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008766	CGT	3	9	31276	31284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008766	CGGG	2	8	31375	31382	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
95	NC_008766	CTT	2	6	31445	31450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008766	GCGG	2	8	31487	31494	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
97	NC_008766	CGG	2	6	31507	31512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008766	CGCGG	2	10	31574	31583	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
99	NC_008766	CAC	2	6	31592	31597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_008766	GCA	2	6	31664	31669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008766	CGG	2	6	31741	31746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008766	GCGCG	2	10	31807	31816	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
103	NC_008766	GC	3	6	31828	31833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008766	GAT	2	6	31850	31855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008766	TCGTG	2	10	31948	31957	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_008766	GGT	2	6	31987	31992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008766	CCG	2	6	32016	32021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_008766	GAT	2	6	32033	32038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008766	TCG	2	6	32043	32048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008766	GCCC	2	8	32050	32057	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
111	NC_008766	CG	3	6	32110	32115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008766	GTG	2	6	32163	32168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008766	TGG	2	6	32234	32239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008766	TC	3	6	32279	32284	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008766	GGTC	2	8	32309	32316	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_008766	CG	3	6	32323	32328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_008766	CCG	2	6	32347	32352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_008766	GCCAG	2	10	32372	32381	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
119	NC_008766	CAG	2	6	32384	32389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008766	GCT	2	6	32392	32397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008766	CGC	2	6	32408	32413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_008766	GAG	2	6	32475	32480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008766	CAG	2	6	34214	34219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008766	TG	3	6	34225	34230	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008766	GC	3	6	34310	34315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_008766	C	7	7	34342	34348	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
127	NC_008766	AACG	2	8	35188	35195	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_008766	GTG	2	6	35646	35651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008766	GGT	2	6	35773	35778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008766	TGG	2	6	35831	35836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008766	ACC	2	6	38853	38858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_008766	GAG	2	6	38907	38912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008766	GAA	2	6	38997	39002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008766	AGC	2	6	39033	39038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008766	GAA	2	6	39075	39080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008766	GCG	2	6	39114	39119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008766	ACA	2	6	39133	39138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008766	TGC	2	6	39160	39165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_008766	GAG	2	6	39177	39182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008766	GCA	2	6	40817	40822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_008766	CG	3	6	40833	40838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_008766	A	6	6	40862	40867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008766	CAGG	2	8	40913	40920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_008766	TCC	2	6	40965	40970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_008766	CGG	2	6	41001	41006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_008766	TCG	2	6	41008	41013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_008766	GGC	2	6	41031	41036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_008766	GCC	2	6	41070	41075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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150	NC_008766	CG	3	6	41113	41118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_008766	GCC	2	6	41119	41124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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153	NC_008766	TCA	2	6	41210	41215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_008766	CGA	3	9	41223	41231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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158	NC_008766	CGG	2	6	41304	41309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_008766	GCG	2	6	41366	41371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_008766	CGC	2	6	41409	41414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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163	NC_008766	CGC	2	6	41718	41723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
164	NC_008766	TGG	2	6	42527	42532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_008766	GAA	2	6	43064	43069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_008766	TCGCC	2	10	43198	43207	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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185	NC_008766	GAT	2	6	43244	43249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
186	NC_008766	GCC	2	6	43283	43288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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242	NC_008766	ACC	2	6	61123	61128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.